Hay dos formas de poner combates,
el modo normal es desde propiedades de mapa con % porcentaje (en algunos maker también hay un área, pensada para el mapa mundi.
El otro modo con mayor control es poner un evento en cada mapa.
En proceso paralelo (debe haber un proceso que al andar sume 1, como pasos. Poder controlar esto es una variable y depende de la versión de rpg maker.
Hay que hacer varias variables.
Luego el evento del mapa tiene que tener algo como (ejemplo) :
Condición - Variable Pasos igual o mayor a 30
Variable Elección enemigos (al azar entre 0-2 por ejemplo
Si es 0 luchar contra 2 limos
Si es 1 luchar contra 3 limos
Si es 2 luchar contra 1 Murciélago
*Tras ganar lo suyo es llamar a un evento común. Y puedes poner cualquier evento.
En mi juego llamo a un evento que muestra en pantalla puntos de habilidad que ganas, (dentro del combate no puedo modificar nada)